Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRF8Q02556 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF8Q02556 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms