Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SP4Q02446 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP4Q02446 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP4Q02446 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP4Q02446 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SP4Q02446 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SP4Q02446 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP4Q02446 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP4Q02446 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP4Q02446 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP4Q02446 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP4Q02446 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP4Q02446 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SP4Q02446 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SP4Q02446 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP4Q02446 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP4Q02446 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP4Q02446 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SP4Q02446 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP4Q02446 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP4Q02446 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP4Q02446 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP4Q02446 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP4Q02446 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP4Q02446 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP4Q02446 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP4Q02446 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP4Q02446 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SP4Q02446 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP4Q02446 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP4Q02446 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP4Q02446 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP4Q02446 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP4Q02446 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SP4Q02446 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP4Q02446 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP4Q02446 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SP4Q02446 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP4Q02446 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP4Q02446 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP4Q02446 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SP4Q02446 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP4Q02446 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP4Q02446 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP4Q02446 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP4Q02446 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP4Q02446 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP4Q02446 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP4Q02446 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP4Q02446 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP4Q02446 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP4Q02446 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP4Q02446 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP4Q02446 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP4Q02446 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP4Q02446 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP4Q02446 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SP4Q02446 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SP4Q02446 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SP4Q02446 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SP4Q02446 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP4Q02446 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP4Q02446 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP4Q02446 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP4Q02446 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SP4Q02446 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP4Q02446 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP4Q02446 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP4Q02446 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP4Q02446 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP4Q02446 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP4Q02446 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP4Q02446 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP4Q02446 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP4Q02446 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SP4Q02446 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SP4Q02446 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP4Q02446 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SP4Q02446 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SP4Q02446 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SP4Q02446 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SP4Q02446 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SP4Q02446 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SP4Q02446 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SP4Q02446 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SP4Q02446 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP4Q02446 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP4Q02446 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SP4Q02446 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SP4Q02446 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SP4Q02446 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP4Q02446 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP4Q02446 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP4Q02446 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP4Q02446 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SP4Q02446 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SP4Q02446 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SP4Q02446 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SP4Q02446 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SP4Q02446 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms