Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC6A3Q01959 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms