Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BEX3Q00994 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BEX3Q00994 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms