Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC42EP1Q00587 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC42EP1Q00587 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC42EP1Q00587 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms