Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARF5P84085 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF5P84085 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF5P84085 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF5P84085 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF5P84085 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF5P84085 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF5P84085 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF5P84085 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARF5P84085 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF5P84085 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF5P84085 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF5P84085 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF5P84085 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF5P84085 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF5P84085 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF5P84085 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF5P84085 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF5P84085 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF5P84085 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF5P84085 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARF5P84085 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF5P84085 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF5P84085 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF5P84085 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF5P84085 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF5P84085 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF5P84085 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF5P84085 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF5P84085 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF5P84085 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARF5P84085 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF5P84085 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF5P84085 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF5P84085 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF5P84085 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARF5P84085 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF5P84085 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF5P84085 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF5P84085 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF5P84085 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF5P84085 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF5P84085 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF5P84085 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF5P84085 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF5P84085 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARF5P84085 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARF5P84085 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF5P84085 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF5P84085 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF5P84085 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF5P84085 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF5P84085 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF5P84085 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF5P84085 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF5P84085 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF5P84085 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF5P84085 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF5P84085 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF5P84085 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF5P84085 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF5P84085 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF5P84085 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF5P84085 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF5P84085 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF5P84085 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF5P84085 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF5P84085 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF5P84085 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF5P84085 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF5P84085 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF5P84085 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF5P84085 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF5P84085 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF5P84085 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF5P84085 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF5P84085 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF5P84085 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF5P84085 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF5P84085 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF5P84085 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF5P84085 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF5P84085 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF5P84085 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF5P84085 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF5P84085 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF5P84085 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF5P84085 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF5P84085 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF5P84085 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF5P84085 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF5P84085 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF5P84085 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF5P84085 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF5P84085 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF5P84085 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF5P84085 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF5P84085 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF5P84085 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF5P84085 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms