Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBP5P82980 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RBP5P82980 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBP5P82980 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBP5P82980 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBP5P82980 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RBP5P82980 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBP5P82980 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RBP5P82980 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBP5P82980 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBP5P82980 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBP5P82980 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBP5P82980 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBP5P82980 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RBP5P82980 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RBP5P82980 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBP5P82980 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBP5P82980 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBP5P82980 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RBP5P82980 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBP5P82980 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBP5P82980 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RBP5P82980 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBP5P82980 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBP5P82980 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBP5P82980 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBP5P82980 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBP5P82980 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBP5P82980 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBP5P82980 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBP5P82980 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RBP5P82980 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RBP5P82980 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBP5P82980 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBP5P82980 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBP5P82980 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBP5P82980 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBP5P82980 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBP5P82980 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBP5P82980 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RBP5P82980 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBP5P82980 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBP5P82980 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBP5P82980 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBP5P82980 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBP5P82980 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBP5P82980 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RBP5P82980 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBP5P82980 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBP5P82980 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBP5P82980 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RBP5P82980 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBP5P82980 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBP5P82980 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBP5P82980 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBP5P82980 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RBP5P82980 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBP5P82980 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBP5P82980 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBP5P82980 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBP5P82980 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBP5P82980 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBP5P82980 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBP5P82980 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RBP5P82980 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBP5P82980 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP5P82980 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP5P82980 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP5P82980 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP5P82980 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP5P82980 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP5P82980 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP5P82980 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP5P82980 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP5P82980 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP5P82980 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP5P82980 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP5P82980 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP5P82980 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBP5P82980 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBP5P82980 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBP5P82980 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBP5P82980 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBP5P82980 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBP5P82980 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBP5P82980 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBP5P82980 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RBP5P82980 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBP5P82980 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBP5P82980 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBP5P82980 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBP5P82980 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBP5P82980 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBP5P82980 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBP5P82980 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBP5P82980 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBP5P82980 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBP5P82980 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBP5P82980 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBP5P82980 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms