Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEP78395 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRAMEP78395 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms