Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPNP63162 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPNP63162 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms