Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRA2BP62995 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms