Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2LP62875 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR2LP62875 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms