Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPFP62306 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPFP62306 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPFP62306 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms