Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK-16P61578 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK-16P61578 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms