Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2D3P61077 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2D3P61077 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms