Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MCCD1P59942 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCCD1P59942 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms