Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LINC00313P59037 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LINC00313P59037 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms