Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RIPK4P57078 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RIPK4P57078 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RIPK4P57078 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RIPK4P57078 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms