Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLDN15P56746 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLDN15P56746 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN15P56746 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms