Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GFRA1P56159 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms