Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH13P55290 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH13P55290 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH13P55290 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH13P55290 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH13P55290 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH13P55290 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH13P55290 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH13P55290 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH13P55290 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH13P55290 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH13P55290 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH13P55290 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH13P55290 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH13P55290 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH13P55290 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH13P55290 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH13P55290 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH13P55290 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH13P55290 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH13P55290 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH13P55290 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH13P55290 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH13P55290 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH13P55290 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH13P55290 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH13P55290 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH13P55290 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH13P55290 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH13P55290 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH13P55290 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH13P55290 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH13P55290 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH13P55290 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH13P55290 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH13P55290 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH13P55290 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH13P55290 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH13P55290 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH13P55290 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH13P55290 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH13P55290 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH13P55290 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH13P55290 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH13P55290 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH13P55290 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH13P55290 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH13P55290 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH13P55290 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH13P55290 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH13P55290 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH13P55290 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH13P55290 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH13P55290 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH13P55290 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH13P55290 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH13P55290 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH13P55290 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH13P55290 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH13P55290 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH13P55290 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH13P55290 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH13P55290 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH13P55290 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH13P55290 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH13P55290 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH13P55290 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH13P55290 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH13P55290 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH13P55290 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH13P55290 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH13P55290 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH13P55290 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH13P55290 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH13P55290 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH13P55290 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH13P55290 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH13P55290 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH13P55290 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH13P55290 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH13P55290 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH13P55290 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH13P55290 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH13P55290 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH13P55290 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH13P55290 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH13P55290 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH13P55290 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH13P55290 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH13P55290 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH13P55290 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH13P55290 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH13P55290 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH13P55290 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH13P55290 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH13P55290 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH13P55290 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH13P55290 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH13P55290 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH13P55290 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms