Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC12A2P55011 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC12A2P55011 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms