Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MVDP53602 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MVDP53602 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MVDP53602 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MVDP53602 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MVDP53602 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MVDP53602 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MVDP53602 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MVDP53602 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MVDP53602 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MVDP53602 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MVDP53602 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MVDP53602 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MVDP53602 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MVDP53602 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MVDP53602 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MVDP53602 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MVDP53602 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MVDP53602 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MVDP53602 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MVDP53602 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MVDP53602 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MVDP53602 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MVDP53602 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MVDP53602 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MVDP53602 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MVDP53602 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MVDP53602 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MVDP53602 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MVDP53602 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MVDP53602 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MVDP53602 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MVDP53602 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MVDP53602 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MVDP53602 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MVDP53602 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MVDP53602 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MVDP53602 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MVDP53602 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MVDP53602 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MVDP53602 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MVDP53602 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MVDP53602 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MVDP53602 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MVDP53602 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MVDP53602 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MVDP53602 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MVDP53602 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MVDP53602 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MVDP53602 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MVDP53602 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MVDP53602 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MVDP53602 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MVDP53602 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MVDP53602 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MVDP53602 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MVDP53602 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MVDP53602 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MVDP53602 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MVDP53602 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MVDP53602 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MVDP53602 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MVDP53602 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MVDP53602 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MVDP53602 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MVDP53602 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MVDP53602 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MVDP53602 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MVDP53602 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MVDP53602 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MVDP53602 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MVDP53602 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MVDP53602 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MVDP53602 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MVDP53602 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MVDP53602 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MVDP53602 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MVDP53602 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MVDP53602 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MVDP53602 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MVDP53602 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MVDP53602 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MVDP53602 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MVDP53602 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms