Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HK3P52790 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HK3P52790 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HK3P52790 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HK3P52790 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HK3P52790 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HK3P52790 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HK3P52790 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HK3P52790 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HK3P52790 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HK3P52790 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HK3P52790 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HK3P52790 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HK3P52790 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HK3P52790 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HK3P52790 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HK3P52790 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HK3P52790 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HK3P52790 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HK3P52790 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HK3P52790 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HK3P52790 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HK3P52790 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HK3P52790 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HK3P52790 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HK3P52790 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HK3P52790 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HK3P52790 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HK3P52790 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HK3P52790 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HK3P52790 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HK3P52790 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HK3P52790 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HK3P52790 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HK3P52790 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
HK3P52790 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HK3P52790 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HK3P52790 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HK3P52790 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HK3P52790 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HK3P52790 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HK3P52790 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HK3P52790 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HK3P52790 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HK3P52790 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HK3P52790 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HK3P52790 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HK3P52790 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HK3P52790 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HK3P52790 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HK3P52790 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HK3P52790 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HK3P52790 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HK3P52790 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HK3P52790 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HK3P52790 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HK3P52790 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HK3P52790 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HK3P52790 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HK3P52790 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HK3P52790 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HK3P52790 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HK3P52790 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HK3P52790 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HK3P52790 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HK3P52790 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HK3P52790 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HK3P52790 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HK3P52790 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HK3P52790 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HK3P52790 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HK3P52790 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HK3P52790 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HK3P52790 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HK3P52790 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HK3P52790 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HK3P52790 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HK3P52790 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HK3P52790 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HK3P52790 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HK3P52790 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HK3P52790 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HK3P52790 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HK3P52790 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HK3P52790 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HK3P52790 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HK3P52790 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HK3P52790 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HK3P52790 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HK3P52790 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HK3P52790 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HK3P52790 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HK3P52790 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HK3P52790 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HK3P52790 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HK3P52790 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HK3P52790 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HK3P52790 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HK3P52790 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HK3P52790 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms