Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF135P52742 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF135P52742 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF135P52742 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF135P52742 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF135P52742 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms