Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGDP52209 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGDP52209 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGDP52209 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGDP52209 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGDP52209 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGDP52209 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGDP52209 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGDP52209 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGDP52209 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGDP52209 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGDP52209 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGDP52209 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PGDP52209 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGDP52209 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGDP52209 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGDP52209 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGDP52209 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGDP52209 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGDP52209 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGDP52209 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGDP52209 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PGDP52209 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGDP52209 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGDP52209 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGDP52209 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGDP52209 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGDP52209 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGDP52209 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGDP52209 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGDP52209 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PGDP52209 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PGDP52209 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGDP52209 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PGDP52209 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGDP52209 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGDP52209 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGDP52209 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGDP52209 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGDP52209 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGDP52209 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGDP52209 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PGDP52209 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGDP52209 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGDP52209 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGDP52209 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGDP52209 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGDP52209 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGDP52209 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGDP52209 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGDP52209 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGDP52209 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGDP52209 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGDP52209 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PGDP52209 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGDP52209 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PGDP52209 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGDP52209 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGDP52209 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGDP52209 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGDP52209 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PGDP52209 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGDP52209 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PGDP52209 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PGDP52209 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGDP52209 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGDP52209 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGDP52209 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PGDP52209 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PGDP52209 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGDP52209 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGDP52209 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGDP52209 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGDP52209 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms