Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK4P51957 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK4P51957 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK4P51957 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK4P51957 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK4P51957 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEK4P51957 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEK4P51957 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEK4P51957 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEK4P51957 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEK4P51957 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEK4P51957 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEK4P51957 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEK4P51957 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEK4P51957 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEK4P51957 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEK4P51957 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEK4P51957 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEK4P51957 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NEK4P51957 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEK4P51957 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEK4P51957 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEK4P51957 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEK4P51957 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEK4P51957 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NEK4P51957 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEK4P51957 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEK4P51957 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEK4P51957 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEK4P51957 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEK4P51957 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEK4P51957 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK4P51957 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK4P51957 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK4P51957 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK4P51957 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK4P51957 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK4P51957 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEK4P51957 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEK4P51957 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK4P51957 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK4P51957 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK4P51957 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK4P51957 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEK4P51957 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEK4P51957 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEK4P51957 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEK4P51957 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEK4P51957 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEK4P51957 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK4P51957 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK4P51957 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK4P51957 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK4P51957 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK4P51957 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK4P51957 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK4P51957 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEK4P51957 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK4P51957 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK4P51957 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK4P51957 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK4P51957 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK4P51957 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK4P51957 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK4P51957 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK4P51957 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK4P51957 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK4P51957 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK4P51957 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK4P51957 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK4P51957 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEK4P51957 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK4P51957 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK4P51957 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK4P51957 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK4P51957 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK4P51957 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK4P51957 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK4P51957 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK4P51957 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEK4P51957 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms