Protein–RNA interactions for Protein: P51809

VAMP7, Vesicle-associated membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP7P51809 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VAMP7P51809 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VAMP7P51809 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP7P51809 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms