Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP1A2P50993 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP1A2P50993 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms