Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX5P50542 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX5P50542 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX5P50542 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX5P50542 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX5P50542 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX5P50542 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX5P50542 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX5P50542 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX5P50542 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX5P50542 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX5P50542 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PEX5P50542 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PEX5P50542 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX5P50542 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX5P50542 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX5P50542 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX5P50542 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX5P50542 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX5P50542 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX5P50542 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX5P50542 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX5P50542 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX5P50542 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX5P50542 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX5P50542 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX5P50542 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX5P50542 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX5P50542 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX5P50542 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX5P50542 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX5P50542 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX5P50542 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX5P50542 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX5P50542 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX5P50542 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX5P50542 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX5P50542 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX5P50542 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX5P50542 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX5P50542 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX5P50542 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX5P50542 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX5P50542 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX5P50542 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX5P50542 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX5P50542 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX5P50542 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX5P50542 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX5P50542 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX5P50542 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX5P50542 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PEX5P50542 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX5P50542 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX5P50542 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX5P50542 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX5P50542 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX5P50542 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX5P50542 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PEX5P50542 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX5P50542 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX5P50542 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX5P50542 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX5P50542 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PEX5P50542 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX5P50542 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX5P50542 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX5P50542 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX5P50542 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX5P50542 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX5P50542 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX5P50542 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX5P50542 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX5P50542 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX5P50542 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX5P50542 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PEX5P50542 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX5P50542 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX5P50542 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX5P50542 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX5P50542 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX5P50542 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX5P50542 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX5P50542 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX5P50542 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX5P50542 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PEX5P50542 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX5P50542 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX5P50542 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX5P50542 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX5P50542 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX5P50542 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX5P50542 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX5P50542 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX5P50542 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX5P50542 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX5P50542 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PEX5P50542 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX5P50542 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PEX5P50542 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms