Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSK3BP49841 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GSK3BP49841 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSK3BP49841 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms