Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARRES1P49788 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARRES1P49788 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms