Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK3P49761 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK3P49761 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK3P49761 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK3P49761 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK3P49761 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK3P49761 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK3P49761 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK3P49761 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK3P49761 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK3P49761 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK3P49761 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK3P49761 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK3P49761 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK3P49761 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK3P49761 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK3P49761 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK3P49761 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK3P49761 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK3P49761 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK3P49761 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLK3P49761 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLK3P49761 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLK3P49761 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLK3P49761 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLK3P49761 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLK3P49761 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLK3P49761 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLK3P49761 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK3P49761 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK3P49761 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK3P49761 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK3P49761 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK3P49761 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK3P49761 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLK3P49761 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLK3P49761 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLK3P49761 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLK3P49761 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLK3P49761 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CLK3P49761 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLK3P49761 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLK3P49761 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLK3P49761 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLK3P49761 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLK3P49761 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLK3P49761 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLK3P49761 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLK3P49761 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLK3P49761 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLK3P49761 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLK3P49761 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLK3P49761 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLK3P49761 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLK3P49761 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLK3P49761 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLK3P49761 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLK3P49761 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLK3P49761 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLK3P49761 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLK3P49761 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLK3P49761 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLK3P49761 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLK3P49761 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLK3P49761 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLK3P49761 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLK3P49761 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLK3P49761 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLK3P49761 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLK3P49761 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLK3P49761 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CLK3P49761 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLK3P49761 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLK3P49761 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLK3P49761 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLK3P49761 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLK3P49761 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLK3P49761 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLK3P49761 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLK3P49761 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLK3P49761 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLK3P49761 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLK3P49761 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLK3P49761 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLK3P49761 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLK3P49761 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLK3P49761 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLK3P49761 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLK3P49761 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLK3P49761 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLK3P49761 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLK3P49761 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK3P49761 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK3P49761 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK3P49761 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK3P49761 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK3P49761 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK3P49761 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK3P49761 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLK3P49761 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms