Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HARS2P49590 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HARS2P49590 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HARS2P49590 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HARS2P49590 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HARS2P49590 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HARS2P49590 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HARS2P49590 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HARS2P49590 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HARS2P49590 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HARS2P49590 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HARS2P49590 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HARS2P49590 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HARS2P49590 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HARS2P49590 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HARS2P49590 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HARS2P49590 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HARS2P49590 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HARS2P49590 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HARS2P49590 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HARS2P49590 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HARS2P49590 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HARS2P49590 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HARS2P49590 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HARS2P49590 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HARS2P49590 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HARS2P49590 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HARS2P49590 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HARS2P49590 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HARS2P49590 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HARS2P49590 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HARS2P49590 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HARS2P49590 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HARS2P49590 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HARS2P49590 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HARS2P49590 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HARS2P49590 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HARS2P49590 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HARS2P49590 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HARS2P49590 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HARS2P49590 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HARS2P49590 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HARS2P49590 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HARS2P49590 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HARS2P49590 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HARS2P49590 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HARS2P49590 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HARS2P49590 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HARS2P49590 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HARS2P49590 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HARS2P49590 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HARS2P49590 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HARS2P49590 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HARS2P49590 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HARS2P49590 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HARS2P49590 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HARS2P49590 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HARS2P49590 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HARS2P49590 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HARS2P49590 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HARS2P49590 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HARS2P49590 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HARS2P49590 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HARS2P49590 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HARS2P49590 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HARS2P49590 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HARS2P49590 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HARS2P49590 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HARS2P49590 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HARS2P49590 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HARS2P49590 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HARS2P49590 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HARS2P49590 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HARS2P49590 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HARS2P49590 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HARS2P49590 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HARS2P49590 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HARS2P49590 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HARS2P49590 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HARS2P49590 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HARS2P49590 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HARS2P49590 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HARS2P49590 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HARS2P49590 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HARS2P49590 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HARS2P49590 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HARS2P49590 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HARS2P49590 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HARS2P49590 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HARS2P49590 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HARS2P49590 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HARS2P49590 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HARS2P49590 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HARS2P49590 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HARS2P49590 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HARS2P49590 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HARS2P49590 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HARS2P49590 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HARS2P49590 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HARS2P49590 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms