Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPFP49454 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPFP49454 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPFP49454 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPFP49454 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPFP49454 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPFP49454 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPFP49454 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPFP49454 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPFP49454 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPFP49454 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPFP49454 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPFP49454 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPFP49454 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPFP49454 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPFP49454 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPFP49454 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPFP49454 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPFP49454 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPFP49454 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPFP49454 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPFP49454 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPFP49454 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPFP49454 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPFP49454 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPFP49454 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPFP49454 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPFP49454 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPFP49454 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPFP49454 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPFP49454 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPFP49454 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPFP49454 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPFP49454 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPFP49454 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPFP49454 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPFP49454 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPFP49454 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPFP49454 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPFP49454 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPFP49454 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPFP49454 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPFP49454 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPFP49454 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPFP49454 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPFP49454 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPFP49454 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPFP49454 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPFP49454 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPFP49454 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPFP49454 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPFP49454 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPFP49454 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPFP49454 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPFP49454 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPFP49454 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPFP49454 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPFP49454 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPFP49454 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPFP49454 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPFP49454 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPFP49454 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPFP49454 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPFP49454 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPFP49454 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPFP49454 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPFP49454 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPFP49454 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPFP49454 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPFP49454 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPFP49454 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPFP49454 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPFP49454 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPFP49454 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPFP49454 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPFP49454 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPFP49454 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPFP49454 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPFP49454 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPFP49454 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPFP49454 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPFP49454 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPFP49454 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPFP49454 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPFP49454 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPFP49454 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPFP49454 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPFP49454 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPFP49454 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPFP49454 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPFP49454 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPFP49454 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPFP49454 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPFP49454 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPFP49454 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPFP49454 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPFP49454 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPFP49454 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPFP49454 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CENPFP49454 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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