Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK8P49336 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK8P49336 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK8P49336 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK8P49336 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK8P49336 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK8P49336 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK8P49336 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK8P49336 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK8P49336 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK8P49336 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK8P49336 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK8P49336 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK8P49336 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK8P49336 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK8P49336 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK8P49336 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK8P49336 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK8P49336 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK8P49336 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK8P49336 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK8P49336 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK8P49336 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK8P49336 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK8P49336 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK8P49336 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK8P49336 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK8P49336 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK8P49336 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK8P49336 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK8P49336 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK8P49336 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK8P49336 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK8P49336 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK8P49336 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK8P49336 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK8P49336 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK8P49336 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK8P49336 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK8P49336 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK8P49336 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK8P49336 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK8P49336 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK8P49336 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK8P49336 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK8P49336 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK8P49336 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK8P49336 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK8P49336 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK8P49336 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK8P49336 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK8P49336 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK8P49336 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK8P49336 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK8P49336 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK8P49336 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK8P49336 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK8P49336 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK8P49336 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK8P49336 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK8P49336 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK8P49336 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK8P49336 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK8P49336 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK8P49336 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK8P49336 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK8P49336 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK8P49336 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK8P49336 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK8P49336 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK8P49336 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK8P49336 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK8P49336 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK8P49336 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK8P49336 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK8P49336 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK8P49336 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK8P49336 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK8P49336 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK8P49336 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK8P49336 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK8P49336 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK8P49336 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK8P49336 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK8P49336 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK8P49336 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK8P49336 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK8P49336 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK8P49336 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK8P49336 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK8P49336 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK8P49336 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK8P49336 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK8P49336 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK8P49336 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK8P49336 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK8P49336 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK8P49336 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK8P49336 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK8P49336 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms