Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TGM4P49221 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM4P49221 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM4P49221 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM4P49221 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM4P49221 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM4P49221 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM4P49221 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM4P49221 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM4P49221 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM4P49221 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM4P49221 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM4P49221 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM4P49221 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TGM4P49221 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM4P49221 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM4P49221 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM4P49221 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM4P49221 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM4P49221 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM4P49221 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM4P49221 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM4P49221 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM4P49221 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM4P49221 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM4P49221 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM4P49221 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM4P49221 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM4P49221 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM4P49221 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TGM4P49221 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM4P49221 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM4P49221 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM4P49221 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM4P49221 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM4P49221 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM4P49221 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM4P49221 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM4P49221 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM4P49221 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM4P49221 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM4P49221 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM4P49221 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TGM4P49221 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM4P49221 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM4P49221 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM4P49221 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM4P49221 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM4P49221 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM4P49221 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM4P49221 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM4P49221 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM4P49221 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TGM4P49221 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TGM4P49221 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TGM4P49221 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM4P49221 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM4P49221 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM4P49221 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM4P49221 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM4P49221 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM4P49221 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM4P49221 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM4P49221 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TGM4P49221 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms