Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRT6CP48668 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT6CP48668 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms