Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RECQLP46063 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RECQLP46063 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RECQLP46063 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RECQLP46063 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RECQLP46063 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RECQLP46063 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RECQLP46063 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RECQLP46063 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RECQLP46063 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RECQLP46063 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RECQLP46063 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RECQLP46063 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RECQLP46063 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RECQLP46063 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RECQLP46063 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RECQLP46063 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RECQLP46063 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RECQLP46063 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RECQLP46063 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RECQLP46063 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RECQLP46063 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RECQLP46063 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RECQLP46063 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RECQLP46063 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RECQLP46063 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RECQLP46063 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RECQLP46063 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RECQLP46063 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RECQLP46063 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RECQLP46063 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RECQLP46063 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RECQLP46063 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RECQLP46063 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RECQLP46063 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RECQLP46063 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RECQLP46063 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RECQLP46063 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RECQLP46063 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RECQLP46063 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RECQLP46063 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RECQLP46063 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RECQLP46063 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RECQLP46063 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RECQLP46063 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RECQLP46063 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RECQLP46063 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RECQLP46063 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RECQLP46063 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RECQLP46063 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RECQLP46063 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RECQLP46063 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RECQLP46063 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RECQLP46063 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RECQLP46063 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RECQLP46063 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RECQLP46063 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RECQLP46063 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RECQLP46063 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RECQLP46063 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RECQLP46063 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RECQLP46063 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RECQLP46063 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RECQLP46063 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RECQLP46063 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RECQLP46063 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RECQLP46063 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RECQLP46063 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RECQLP46063 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RECQLP46063 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RECQLP46063 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RECQLP46063 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RECQLP46063 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RECQLP46063 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RECQLP46063 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RECQLP46063 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RECQLP46063 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RECQLP46063 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RECQLP46063 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RECQLP46063 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RECQLP46063 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms