Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MAP2K4P45985 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MAP2K4P45985 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms