Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC1P41238 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC1P41238 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC1P41238 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms