Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POLR2IP36954 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2IP36954 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2IP36954 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms