Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHI3L1P36222 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHI3L1P36222 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHI3L1P36222 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHI3L1P36222 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHI3L1P36222 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHI3L1P36222 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHI3L1P36222 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHI3L1P36222 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHI3L1P36222 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHI3L1P36222 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHI3L1P36222 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHI3L1P36222 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHI3L1P36222 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHI3L1P36222 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHI3L1P36222 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHI3L1P36222 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHI3L1P36222 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms