Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYH11P35749 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYH11P35749 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYH11P35749 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MYH11P35749 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYH11P35749 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYH11P35749 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYH11P35749 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYH11P35749 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYH11P35749 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYH11P35749 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYH11P35749 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYH11P35749 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYH11P35749 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYH11P35749 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYH11P35749 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYH11P35749 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYH11P35749 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYH11P35749 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MYH11P35749 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYH11P35749 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYH11P35749 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYH11P35749 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYH11P35749 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYH11P35749 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYH11P35749 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYH11P35749 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYH11P35749 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYH11P35749 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYH11P35749 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYH11P35749 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYH11P35749 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYH11P35749 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYH11P35749 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYH11P35749 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYH11P35749 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MYH11P35749 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYH11P35749 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYH11P35749 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYH11P35749 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYH11P35749 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYH11P35749 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYH11P35749 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYH11P35749 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYH11P35749 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MYH11P35749 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYH11P35749 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYH11P35749 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYH11P35749 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYH11P35749 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYH11P35749 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYH11P35749 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYH11P35749 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYH11P35749 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYH11P35749 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYH11P35749 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYH11P35749 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYH11P35749 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MYH11P35749 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYH11P35749 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYH11P35749 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYH11P35749 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MYH11P35749 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYH11P35749 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYH11P35749 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYH11P35749 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYH11P35749 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYH11P35749 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYH11P35749 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYH11P35749 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYH11P35749 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYH11P35749 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYH11P35749 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYH11P35749 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYH11P35749 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYH11P35749 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYH11P35749 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYH11P35749 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYH11P35749 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYH11P35749 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYH11P35749 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYH11P35749 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYH11P35749 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYH11P35749 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYH11P35749 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYH11P35749 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYH11P35749 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYH11P35749 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYH11P35749 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYH11P35749 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYH11P35749 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYH11P35749 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYH11P35749 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYH11P35749 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYH11P35749 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYH11P35749 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYH11P35749 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYH11P35749 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYH11P35749 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYH11P35749 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms