Protein–RNA interactions for Protein: P35218

CA5A, Carbonic anhydrase 5A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA5AP35218 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA5AP35218 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA5AP35218 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA5AP35218 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CA5AP35218 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA5AP35218 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA5AP35218 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA5AP35218 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA5AP35218 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA5AP35218 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA5AP35218 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA5AP35218 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA5AP35218 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA5AP35218 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CA5AP35218 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA5AP35218 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA5AP35218 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA5AP35218 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA5AP35218 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA5AP35218 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA5AP35218 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CA5AP35218 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CA5AP35218 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA5AP35218 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA5AP35218 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA5AP35218 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA5AP35218 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA5AP35218 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA5AP35218 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA5AP35218 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA5AP35218 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA5AP35218 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA5AP35218 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA5AP35218 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA5AP35218 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA5AP35218 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA5AP35218 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CA5AP35218 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA5AP35218 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA5AP35218 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA5AP35218 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA5AP35218 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA5AP35218 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA5AP35218 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA5AP35218 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA5AP35218 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CA5AP35218 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CA5AP35218 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA5AP35218 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA5AP35218 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA5AP35218 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA5AP35218 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA5AP35218 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CA5AP35218 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CA5AP35218 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA5AP35218 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA5AP35218 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA5AP35218 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA5AP35218 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA5AP35218 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA5AP35218 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA5AP35218 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA5AP35218 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA5AP35218 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA5AP35218 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA5AP35218 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA5AP35218 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CA5AP35218 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA5AP35218 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA5AP35218 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA5AP35218 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA5AP35218 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA5AP35218 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA5AP35218 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA5AP35218 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA5AP35218 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA5AP35218 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA5AP35218 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA5AP35218 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA5AP35218 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA5AP35218 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA5AP35218 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA5AP35218 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms