Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC8A1P32418 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC8A1P32418 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms