Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFNP31947 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SFNP31947 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFNP31947 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFNP31947 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SFNP31947 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SFNP31947 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFNP31947 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFNP31947 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFNP31947 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFNP31947 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFNP31947 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFNP31947 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFNP31947 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SFNP31947 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFNP31947 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFNP31947 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFNP31947 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFNP31947 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFNP31947 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SFNP31947 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SFNP31947 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SFNP31947 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SFNP31947 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFNP31947 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SFNP31947 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFNP31947 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFNP31947 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFNP31947 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SFNP31947 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFNP31947 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SFNP31947 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFNP31947 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFNP31947 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFNP31947 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFNP31947 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFNP31947 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFNP31947 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SFNP31947 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFNP31947 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFNP31947 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFNP31947 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFNP31947 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFNP31947 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFNP31947 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFNP31947 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFNP31947 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFNP31947 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFNP31947 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFNP31947 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFNP31947 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFNP31947 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFNP31947 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFNP31947 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFNP31947 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFNP31947 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFNP31947 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SFNP31947 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFNP31947 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFNP31947 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFNP31947 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFNP31947 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFNP31947 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFNP31947 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFNP31947 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SFNP31947 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SFNP31947 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SFNP31947 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SFNP31947 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFNP31947 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFNP31947 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFNP31947 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFNP31947 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFNP31947 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFNP31947 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFNP31947 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SFNP31947 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFNP31947 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFNP31947 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFNP31947 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFNP31947 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFNP31947 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFNP31947 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFNP31947 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFNP31947 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFNP31947 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFNP31947 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SFNP31947 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFNP31947 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFNP31947 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFNP31947 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFNP31947 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFNP31947 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFNP31947 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFNP31947 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFNP31947 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFNP31947 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFNP31947 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SFNP31947 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFNP31947 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms