Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCND2P30279 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCND2P30279 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCND2P30279 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND2P30279 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND2P30279 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND2P30279 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND2P30279 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND2P30279 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND2P30279 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND2P30279 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND2P30279 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND2P30279 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCND2P30279 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND2P30279 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND2P30279 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND2P30279 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND2P30279 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND2P30279 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCND2P30279 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND2P30279 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND2P30279 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND2P30279 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND2P30279 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND2P30279 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND2P30279 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND2P30279 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCND2P30279 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCND2P30279 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCND2P30279 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCND2P30279 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCND2P30279 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCND2P30279 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCND2P30279 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCND2P30279 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND2P30279 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND2P30279 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND2P30279 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND2P30279 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND2P30279 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND2P30279 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCND2P30279 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND2P30279 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND2P30279 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND2P30279 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND2P30279 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND2P30279 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND2P30279 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND2P30279 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND2P30279 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND2P30279 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCND2P30279 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND2P30279 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND2P30279 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND2P30279 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND2P30279 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND2P30279 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND2P30279 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND2P30279 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCND2P30279 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND2P30279 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND2P30279 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND2P30279 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND2P30279 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND2P30279 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND2P30279 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND2P30279 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND2P30279 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND2P30279 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND2P30279 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND2P30279 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND2P30279 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCND2P30279 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND2P30279 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND2P30279 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND2P30279 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND2P30279 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND2P30279 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND2P30279 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND2P30279 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND2P30279 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCND2P30279 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCND2P30279 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCND2P30279 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCND2P30279 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCND2P30279 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCND2P30279 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCND2P30279 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCND2P30279 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCND2P30279 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCND2P30279 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCND2P30279 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCND2P30279 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCND2P30279 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCND2P30279 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCND2P30279 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCND2P30279 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCND2P30279 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCND2P30279 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCND2P30279 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms