Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTFP26441 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTFP26441 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTFP26441 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTFP26441 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTFP26441 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTFP26441 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTFP26441 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTFP26441 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTFP26441 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTFP26441 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTFP26441 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTFP26441 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTFP26441 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTFP26441 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTFP26441 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTFP26441 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTFP26441 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTFP26441 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTFP26441 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTFP26441 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTFP26441 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTFP26441 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTFP26441 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTFP26441 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTFP26441 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTFP26441 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTFP26441 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTFP26441 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTFP26441 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTFP26441 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTFP26441 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTFP26441 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTFP26441 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTFP26441 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTFP26441 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTFP26441 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTFP26441 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTFP26441 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTFP26441 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTFP26441 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTFP26441 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTFP26441 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTFP26441 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTFP26441 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTFP26441 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTFP26441 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTFP26441 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTFP26441 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTFP26441 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTFP26441 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTFP26441 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTFP26441 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTFP26441 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTFP26441 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTFP26441 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTFP26441 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTFP26441 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTFP26441 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTFP26441 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTFP26441 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTFP26441 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTFP26441 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTFP26441 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTFP26441 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTFP26441 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTFP26441 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTFP26441 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTFP26441 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTFP26441 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTFP26441 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTFP26441 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTFP26441 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTFP26441 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTFP26441 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTFP26441 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTFP26441 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTFP26441 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTFP26441 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTFP26441 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTFP26441 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTFP26441 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTFP26441 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTFP26441 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTFP26441 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTFP26441 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTFP26441 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTFP26441 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTFP26441 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTFP26441 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTFP26441 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTFP26441 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTFP26441 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTFP26441 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTFP26441 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTFP26441 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTFP26441 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTFP26441 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTFP26441 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTFP26441 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms