Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.226e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.26e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.196e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.196e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.146e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.136e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.056e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 BMF-208ENST00000560430 490 ntTSL 315.15■□□□□ 0.026e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 06e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 DCP1B-204ENST00000537725 598 ntTSL 315.06■□□□□ 06e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.026e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.046e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.056e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 31.2
DDX6P26196 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.096e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.166e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.176e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.196e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.236e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.256e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.286e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.296e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 MAGI1-203ENST00000460329 3694 ntTSL 513.17□□□□□ -0.36e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.336e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 ID3-202ENST00000463312 623 ntTSL 212.81□□□□□ -0.366e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.386e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.396e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 MAGI1-204ENST00000463103 4193 ntTSL 512.28□□□□□ -0.446e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 TCF7L2-223ENST00000629706 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.536e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 MTA2-202ENST00000524902 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 31.2
DDX6P26196 BMF-203ENST00000431415 492 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.586e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 TCF7L2-213ENST00000471569 330 ntTSL 511.3□□□□□ -0.66e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 OSMR-205ENST00000513831 766 ntTSL 311.17□□□□□ -0.626e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 BRD4-203ENST00000371835 4624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.646e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 TCF7L2-211ENST00000466338 1026 ntTSL 210.97□□□□□ -0.656e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 MLEC-203ENST00000535413 617 ntTSL 210.76□□□□□ -0.696e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 TCF7L2-212ENST00000470254 768 ntTSL 510.33□□□□□ -0.766e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 BMF-210ENST00000561360 735 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.786e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 BMF-202ENST00000397573 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.86e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 LCOR-209ENST00000540664 2213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.96e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 TCF7L2-205ENST00000355717 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.916e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 TCF7L2-204ENST00000352065 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.926e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 NR2F2-202ENST00000394171 3501 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.928e-7■■■■■ 31.2
DDX6P26196 ATP2A2-202ENST00000313432 5575 ntTSL 1 (best)8.53□□□□□ -1.046e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 TCF7L2-221ENST00000545257 2160 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.066e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.096e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 MAGI1-207ENST00000470990 2138 ntTSL 1 (best)8.19□□□□□ -1.16e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.146e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 CEBPG-202ENST00000585933 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.146e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 C1orf43-208ENST00000483282 456 ntTSL 37.9□□□□□ -1.146e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.216e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.236e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 TCF7L2-207ENST00000369386 1274 ntTSL 57.28□□□□□ -1.246e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.266e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.376e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 TCF7L2-201ENST00000277945 620 ntTSL 56.1□□□□□ -1.436e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 TCF7L2-215ENST00000494353 500 ntTSL 34.53□□□□□ -1.686e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 ATP2A2-212ENST00000553144 264 ntTSL 1 (best)4.31□□□□□ -1.726e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.726e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.746e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 ECT2-209ENST00000437296 2266 ntTSL 53.81□□□□□ -1.86e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 LCOR-208ENST00000493486 245 ntTSL 33.64□□□□□ -1.836e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 TCF7L2-214ENST00000480888 182 ntTSL 5-0.44□□□□□ -2.486e-6■■■■■ 31.2
DDX6P26196 TXNIP-202ENST00000486597 509 ntTSL 24.89□□□□□ -1.635e-7■■■■■ 31.2
DDX6P26196 BBC3-206ENST00000601438 1747 nt17.98■□□□□ 0.479e-7■■■■■ 31.1
DDX6P26196 YPEL3-212ENST00000570099 669 ntTSL 313.89□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 31.1
DDX6P26196 PASD1-201ENST00000370357 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 31.1
DDX6P26196 PASD1-202ENST00000464219 4098 ntTSL 27.19□□□□□ -1.263e-6■■■■■ 31.1
DDX6P26196 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.262e-10■■■■■ 31.1
DDX6P26196 C2orf48-202ENST00000619640 480 ntTSL 1 (best)16.16■□□□□ 0.182e-10■■■■■ 31.1
DDX6P26196 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.112e-10■■■■■ 31.1
DDX6P26196 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.285e-7■■■■■ 31.1
DDX6P26196 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.56e-7■■■■■ 31
DDX6P26196 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.068e-7■■■■■ 31
DDX6P26196 CEP72-203ENST00000512038 656 ntTSL 217.98■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 31
DDX6P26196 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 31
DDX6P26196 DCTN1-225ENST00000497666 479 ntTSL 317.19■□□□□ 0.345e-6■■■■■ 30.8
DDX6P26196 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 30.8
DDX6P26196 DCTN1-218ENST00000466110 5414 ntTSL 212.84□□□□□ -0.355e-6■■■■■ 30.8
DDX6P26196 DCTN1-210ENST00000434055 4229 ntTSL 212.27□□□□□ -0.455e-6■■■■■ 30.8
DDX6P26196 DCTN1-206ENST00000409868 4202 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.535e-6■■■■■ 30.8
DDX6P26196 DCTN1-201ENST00000361874 4500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.645e-6■■■■■ 30.8
DDX6P26196 DCTN1-227ENST00000633691 4160 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.645e-6■■■■■ 30.8
DDX6P26196 DCTN1-202ENST00000394003 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.715e-6■■■■■ 30.8
DDX6P26196 DCTN1-204ENST00000409438 4145 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.775e-6■■■■■ 30.8
DDX6P26196 DCTN1-226ENST00000628224 4485 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.95e-6■■■■■ 30.8
DDX6P26196 DCTN1-205ENST00000409567 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.975e-6■■■■■ 30.8
DDX6P26196 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.67e-8■■■■■ 30.6
DDX6P26196 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.277e-8■■■■■ 30.6
DDX6P26196 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 07e-17■■■■■ 30.6
DDX6P26196 MGAT1-210ENST00000506033 464 ntTSL 230.55■■■□□ 2.481e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT1-213ENST00000506889 1104 ntTSL 224.72■■□□□ 1.551e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT4B-221ENST00000523108 1080 ntTSL 523.65■■□□□ 1.381e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT4B-212ENST00000520134 592 ntTSL 323.65■■□□□ 1.381e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT4B-211ENST00000520019 831 ntTSL 323.65■■□□□ 1.381e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT4B-208ENST00000519616 522 ntTSL 522.94■■□□□ 1.261e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 SH3BP5-204ENST00000412806 1900 ntTSL 521.68■■□□□ 1.063e-14■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT1-224ENST00000514438 607 ntTSL 421.28■■□□□ 11e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 MGAT4B-203ENST00000518168 1013 ntTSL 220.1■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 30.5
DDX6P26196 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.781e-7■■■■■ 30.5
Retrieved 100 of 14,483 protein–RNA pairs in 406.9 ms