Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PSMA1P25786 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms